Figuur 6: De paracellulaire versus transcellulaire weg

Stoffen en cellen kunnen op 2 verschillende manieren de BBB doorkruisen namelijk via de paracellulaire en transcellulaire weg.

De paracellulaire weg gebeurt tussen 2 cellen door, waarbij moleculen oversteken langs de tight junctions van 2 aaneensluitende EC. De tweede mogelijkheid is via de transcellulaire weg waarbij de celmembraan zelf doorkruist wordt. Op een nog onbekende manier vormen cellen die de BBB willen doorkruisen een soort van tijdelijke tunnels doorheen de BBB endotheelcellen. Deze transcellulaire weg is uniek voor de BBB en wordt nergens anders in de bloedvaten teruggevonden.